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En septiembre de 1996, la ODHAG, Famdegua y el Centro 
por la Justicia y el Derecho Internacional (CEJIL) llevaron 
el caso a la Corte Interamericana de Derechos Humanos 
(CIDH) y en abril del 2000 se llegó a una solución amistosa 
en la cual el Estado se comprometió a indemnizar a las vícti-
mas e investigar el caso.

En diciembre de 2001, el presidente Alfonso Portillo pi-
dió perdón por la masacre en nombre del Estado, el cual 
le otorgó a 176 familiares de las víctimas un resarcimien-
to de Q14.5 millones. Sin embargo, no se indemnizó a las 
personas que habían perdido niños durante la masacre y la 
investigación del caso siguió engavetada, motivo por el cual, 
en 2006, los representantes de las víctimas se sustrajeron del 
acuerdo amistoso y se avocaron de nuevo a la CIDH. Como 
dijo Edgar Pérez Archila, abogado de Famdegua, que ha ac-
tuado como querellante adhesivo en el caso de Dos Erres, “el 
Estado pensó que con el resarcimiento podía comprarles sus 
muertos y que se olvidaran de hacer justicia”.

Dos años después el Fiscal General Juan Luis Florido, pre-
sentó su renuncia a petición del presidente Álvaro Colom en 
el contexto de fuertes presiones por parte de la CICIG y de 
organizaciones de la sociedad civil que lo señalaban de obs-
truir las investigaciones.

Florido fue relevado por Amílcar Velásquez de Zárate, quien 
ordenó que se priorizaran casos paradigmáticos entre ellos 
el genocidio perpetrado contra el pueblo maya Ixil bajo la 
dictadura de Ríos Montt, la masacre de Dos Erres, la masa-
cre de Plan de Sánchez, cometida en Baja Verapaz en 1982.

Bajo su administración el Ministerio Público también sus-
cribió un convenio con la FAFG para que ésta asumiera la 
realización de los peritajes forenses en los casos relacionados