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Con base en estas suposiciones, se utilizan microsatélites (SSR) como marcadores
mendelianos para estudios en genética de poblaciones, relaciones evolutivas y mapeo
genético.
3.10.2 Ventajas y aplicaciones de los SSR
En los últimos años, los SSR se han convertido en los marcadores moleculares más
populares usados en diferentes campos. Su alto polimorfismo y su facilidad de marcado
o etiquetado los han privilegiado para hacer varios estudios genéticos, como son:
•
Genética de poblaciones,
•
Mapeo
genético,
•
Estudios
forenses,
•
Manejo y conservación de recursos biológicos, y
•
Estudios de paternidad.
El único inconveniente de los SSR es que estos deben ser aislados cada vez que las
especies van a ser examinadas por primera vez. Se ha comprobado que la estrategia
de diseñar primers universales es más problemática para los SSR. Se dan algunas
excepciones con SSR altamente conservados de ballenas, tortugas y peces que
permitieron amplificación cruzada de especies que divergieron hace 470 millones de
años. Existen numerosos protocolos para el aislamiento e identificación de
microsatélites, a la fecha hay varios artículos que proponen métodos que permiten
mejorar la eficiencia en detección de SSR en aquellas especies como aves y plantas
donde el número de SSR es relativamente bajo (Zane et al, 2002). Se ha visto que la
secuencia que se repite en un SSR varía de una especie a otra, por lo cual los distintos
métodos de detección de estas secuencias generalmente funcionan en otros
organismos.
En síntesis, los microsatélites se han convertido en una técnica casi obligatoria en los
estudios genéticos, pero algunos aspectos como su aislamiento siguen abiertos a la
investigación. Los protocolos de trabajo siguen actualizándose constantemente, se
pueden encontrar en el internet y en las instituciones que realizan modificaciones según
sus condiciones de trabajo. Particularmente, el Centro Agronómico Tropical de
Investigación y Enseñanza (CATIE) ha mejorado y rediseñado una serie de protocolos
de amplificación de ADN para las técnicas moleculares RAPDs, SSR y AFLP que han
optimizado los resultados obtenidos en el laboratorio de biología molecular (Astorga &
Quirós, 2004).
Entre 1995 y 2000 se han encontrado alrededor de 8,000 registros en la base de datos
de los “Current contents” que tienen la palabra “microsatélites” (Zane, 2002). En
Instituto de Agricultura, Recursos Naturales y Ambiente de la URL Serie técnica No. 15